Menyadari tantangan yang dihadapi bangsa Indonesia ke depan semakin kompleks dan beragam dan kekuatan ekonomi ummat semakin termarginalkan serta dikhawatirkan akan berdampak pada ketahanan aqidah ummat, para habaib, para ulama, para kiyai dan para cendikia melakukan urun rembuk mencari solusi untuk mengembalikan marwah pondok pesantren sebagai pelaku pembangunan bangsa, sebagaimana yang telah dilakukan para pendahulu sejak zaman Penjajahan sampai dengan pasca kemerdekaan.
Pertumbuhan pondok pesantren yang cukup pesat mencapai 30.000 pada tahun 2016, dengan segala kelebihan dan kekurangannya, merupakan potensi besar yang dapat ditumbuh-kembangkan melalui sinergisitas diantara Pondok Pesantren tersebut dalam usaha meningkatkan peran serta dan kontribusinya yang nyata terhadap pembangunan Bangsa Indonesia di masa yang akan datang. Dalam upaya untuk mewujudkan cita-cita yang mulia ini, dirasakan perlu adanya wadah yang diikat dalam gerakan sinergi yang diwujudkan dalam lembaga sosial keagamaan bernama YAYASAN PENGUATAN PERAN PESANTREN INDONESIA disingkat YP3I.
Terwujudnya pesantren sebagai garda terdepan pembangunan bangsa
Memperkuat peran pesantren sebagai benteng pembangunan karakter anak bangsa.
Mensinergikan kekuatan pesantren dalam pembangunan ekonomi ummat.
Memposisikan pesantren sebagai salah satu kekuatan kepemimpinan bangsa
Merajut silaturahim dan koordinasi antar pondok pesantren Se-Indonesia.
Sinergi antar pondok pesantren, para pengusaha muslim, dan kaum muslimin.
Penguatan tarbiyah, iqtishodiyah, dan dakwah pondok pesantren.
Kesepahaman program tindak lanjut penguatan peran pesantren dalam kemandirian dan kedaulatan tarbiyah, iqtishodiyah dan pondok pesantren.
Mewujudkan peran pesantren sebagai garda terdepan pembangunan bangsa.
Memberikan advokasi dan perlindungan pondok pesantren.